Bij een thermische zonne-installatie hebben de pomp en de regeling natuurlijk elektriciteit nodig. Deze kost komt op ongeveer 15 euro per jaar.  
Een regelmatig onderhoud verzekerd de verwachte lange levensduur van het zonnesysteem. Het onderhoudsinterval is twee jaar. Hierbij zal vooral de werking van het systeem en de pH-waarde van de zonnevloeistof worden gecontroleerd. Deze vloeistof moet bij een normale werking ongeveer  om de 6 tot 8 jaar worden vervangen. Dit kost ongeveer 70 euro. 

Aangezien stookolie installatie's jaarlijks en gas installatie's tweejaarlijks wettelijk moeten onderhouden worden kan het onderhoud van het zonnesysteem gelijktijdig om de 2 jaar plaats vinden. Aldus zullen de werkings-en onderhoudskosten voor het zonnesysteem slechts ongeveer € 35 per jaar bedragen. 

Met een zogenaamde warmtemeter kan men zonder veel extra kosten, een precieze opbrengst van de hoeveelheid zonnewarmte registreren. Hiermee kan ook worden gecontroleerd of de prestatie's van het systeem aan de verwachtingen voldoen en heeft men tevens de controle wanneer er zich een probleem zou voordoen.